Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A2

PPIAL4C, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4C, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPIAL4CA0A0B4J2A2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPIAL4CA0A0B4J2A2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPIAL4CA0A0B4J2A2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIAL4CA0A0B4J2A2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPIAL4CA0A0B4J2A2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPIAL4CA0A0B4J2A2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPIAL4CA0A0B4J2A2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms