Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRBV23-1A0A0A0MS06 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRBV23-1A0A0A0MS06 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRBV23-1A0A0A0MS06 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRBV23-1A0A0A0MS06 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRBV23-1A0A0A0MS06 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRBV23-1A0A0A0MS06 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV23-1A0A0A0MS06 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRBV23-1A0A0A0MS06 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRBV23-1A0A0A0MS06 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRBV23-1A0A0A0MS06 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBV23-1A0A0A0MS06 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBV23-1A0A0A0MS06 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRBV23-1A0A0A0MS06 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBV23-1A0A0A0MS06 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV23-1A0A0A0MS06 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV23-1A0A0A0MS06 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBV23-1A0A0A0MS06 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBV23-1A0A0A0MS06 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV23-1A0A0A0MS06 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBV23-1A0A0A0MS06 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV23-1A0A0A0MS06 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV23-1A0A0A0MS06 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV23-1A0A0A0MS06 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV23-1A0A0A0MS06 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV23-1A0A0A0MS06 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV23-1A0A0A0MS06 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV23-1A0A0A0MS06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV23-1A0A0A0MS06 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV23-1A0A0A0MS06 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV23-1A0A0A0MS06 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV23-1A0A0A0MS06 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV23-1A0A0A0MS06 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBV23-1A0A0A0MS06 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV23-1A0A0A0MS06 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV23-1A0A0A0MS06 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV23-1A0A0A0MS06 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV23-1A0A0A0MS06 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV23-1A0A0A0MS06 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV23-1A0A0A0MS06 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV23-1A0A0A0MS06 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRBV23-1A0A0A0MS06 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV23-1A0A0A0MS06 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV23-1A0A0A0MS06 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV23-1A0A0A0MS06 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV23-1A0A0A0MS06 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV23-1A0A0A0MS06 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV23-1A0A0A0MS06 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV23-1A0A0A0MS06 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV23-1A0A0A0MS06 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV23-1A0A0A0MS06 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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