Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 DARS-211ENST00000491481 549 ntTSL 24.15□□□□□ -1.756e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEC31A-212ENST00000503226 613 ntTSL 35.96□□□□□ -1.461e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEC31A-235ENST00000512732 551 ntTSL 45.44□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.082e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CNOT1-219ENST00000569882 831 ntTSL 35.95□□□□□ -1.463e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CYP27A1-204ENST00000466602 1210 ntTSL 228.51■■■□□ 2.153e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt15.77■□□□□ 0.112e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.372e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-213ENST00000565834 1671 ntTSL 523.19■■□□□ 1.32e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.32e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.222e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-218ENST00000567377 461 ntTSL 322.48■■□□□ 1.192e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 222.25■■□□□ 1.152e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 522.23■■□□□ 1.152e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-220ENST00000567720 544 ntTSL 421.31■■□□□ 12e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-206ENST00000562610 850 ntTSL 319.98■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTTN-215ENST00000533931 567 ntTSL 319.31■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-223ENST00000568301 666 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-215ENST00000566843 2284 ntTSL 218.39■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-225ENST00000569245 867 ntTSL 217.9■□□□□ 0.462e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-221ENST00000567935 502 ntTSL 317.89■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTTN-213ENST00000529736 952 ntTSL 317.8■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-205ENST00000562310 568 ntTSL 317.63■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 317.58■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 217.14■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 316.29■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PPP6R1-202ENST00000586690 668 ntTSL 215.32■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-206ENST00000455263 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-219ENST00000610538 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt15.04■□□□□ -02e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-220ENST00000531532 554 ntTSL 414.58□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 414.52□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 414.52□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-227ENST00000622645 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-204ENST00000420246 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-202ENST00000359597 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-228ENST00000635293 1883 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 414.16□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-218ENST00000610292 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEPT8-213ENST00000481030 790 ntTSL 313.91□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 AMBRA1-204ENST00000526545 837 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-203ENST00000413465 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-213ENST00000510385 2404 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-223ENST00000618944 2404 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 AMBRA1-202ENST00000458649 5351 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-224ENST00000619186 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-209ENST00000504937 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 MYH10-210ENST00000488329 538 ntTSL 212.87□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 IDH3B-205ENST00000466999 521 ntTSL 212.79□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-212ENST00000509690 729 ntTSL 412.76□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KDM2A-213ENST00000531696 4160 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-225ENST00000619485 2506 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TP53-205ENST00000445888 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 YEATS2-202ENST00000432781 1024 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.27□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 9.5
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 266.2 ms