RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495274.1

PFKL-209, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 2

Gene PFKL, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-209ENST00000495274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.58■■■■□ 3.93
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PFKL-209ENST00000495274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
PFKL-209ENST00000495274 NACADO15069 1562 aa32.93■■■□□ 2.86
PFKL-209ENST00000495274 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.88■■■□□ 2.85
PFKL-209ENST00000495274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.87■■■□□ 2.85
PFKL-209ENST00000495274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.86■■■□□ 2.85
PFKL-209ENST00000495274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.82■■■□□ 2.84
PFKL-209ENST00000495274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.12■■■□□ 2.73
PFKL-209ENST00000495274 SCRIBQ14160 1630 aa31.93■■■□□ 2.7
PFKL-209ENST00000495274 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.9■■■□□ 2.7
PFKL-209ENST00000495274 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.697e-7■■■□□ 16.3
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PFKL-209ENST00000495274 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.07■■■□□ 2.56
PFKL-209ENST00000495274 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PFKL-209ENST00000495274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.8■■■□□ 2.52
PFKL-209ENST00000495274 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.79■■■□□ 2.52
PFKL-209ENST00000495274 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PFKL-209ENST00000495274 SMARCA4P51532 1647 aa30.62■■■□□ 2.49
PFKL-209ENST00000495274 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.49■■■□□ 2.47
PFKL-209ENST00000495274 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.44■■■□□ 2.46
PFKL-209ENST00000495274 NCAPD3P42695 1498 aa30.42■■■□□ 2.46
PFKL-209ENST00000495274 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.4■■■□□ 2.46
PFKL-209ENST00000495274 SMARCA2P51531 1590 aa30.39■■■□□ 2.46
PFKL-209ENST00000495274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PFKL-209ENST00000495274 HMGXB3Q12766 1538 aa30.24■■■□□ 2.43
PFKL-209ENST00000495274 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
PFKL-209ENST00000495274 WIZO95785 1651 aa30.14■■■□□ 2.41
PFKL-209ENST00000495274 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PFKL-209ENST00000495274 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PFKL-209ENST00000495274 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.53■■■□□ 2.32
PFKL-209ENST00000495274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.52■■■□□ 2.32
PFKL-209ENST00000495274 NESP48681 1621 aa29.52■■■□□ 2.32
PFKL-209ENST00000495274 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.52■■■□□ 2.32
PFKL-209ENST00000495274 CFTRP13569 1480 aa29.4■■■□□ 2.3
PFKL-209ENST00000495274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.32■■■□□ 2.28
PFKL-209ENST00000495274 ERCC6Q03468 1493 aa29.27■■■□□ 2.28
PFKL-209ENST00000495274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.15■■■□□ 2.26
PFKL-209ENST00000495274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.14■■■□□ 2.26
PFKL-209ENST00000495274 PRDM2Q13029 1718 aa29.13■■■□□ 2.25
PFKL-209ENST00000495274 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.06■■■□□ 2.24
PFKL-209ENST00000495274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PFKL-209ENST00000495274 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.97■■■□□ 2.23
PFKL-209ENST00000495274 CUX2O14529 1486 aa28.95■■■□□ 2.22
PFKL-209ENST00000495274 WDR62O43379 1518 aa28.89■■■□□ 2.22
PFKL-209ENST00000495274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PFKL-209ENST00000495274 ABCC8Q09428 1581 aa28.76■■■□□ 2.19
PFKL-209ENST00000495274 TOPBP1Q92547 1522 aa28.71■■■□□ 2.19
PFKL-209ENST00000495274 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.68■■■□□ 2.18
PFKL-209ENST00000495274 CUX1P39880 1505 aa28.58■■■□□ 2.17
PFKL-209ENST00000495274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
PFKL-209ENST00000495274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PFKL-209ENST00000495274 IFT140Q96RY7 1462 aa28.46■■■□□ 2.15
PFKL-209ENST00000495274 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.43■■■□□ 2.14
PFKL-209ENST00000495274 TOP2BQ02880 1626 aa28.41■■■□□ 2.14
PFKL-209ENST00000495274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.4■■■□□ 2.14
PFKL-209ENST00000495274 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
PFKL-209ENST00000495274 SYNJ1O43426 1573 aa28.38■■■□□ 2.13
PFKL-209ENST00000495274 SOGA1O94964 1423 aa28.37■■■□□ 2.13
PFKL-209ENST00000495274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.34■■■□□ 2.13
PFKL-209ENST00000495274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PFKL-209ENST00000495274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.21■■■□□ 2.11
PFKL-209ENST00000495274 WDR97A6NE52 1622 aa28.2■■■□□ 2.1
PFKL-209ENST00000495274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.11e-7■■■□□ 16.3
PFKL-209ENST00000495274 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PFKL-209ENST00000495274 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PFKL-209ENST00000495274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.05■■■□□ 2.08
PFKL-209ENST00000495274 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.04■■■□□ 2.08
PFKL-209ENST00000495274 GRIN2BQ13224 1484 aa28.01■■■□□ 2.07
PFKL-209ENST00000495274 TRIM41Q8WV44 630 aa27.97■■■□□ 2.07
PFKL-209ENST00000495274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
PFKL-209ENST00000495274 PBRM1Q86U86 1689 aa27.91■■■□□ 2.06
PFKL-209ENST00000495274 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.89■■■□□ 2.06
PFKL-209ENST00000495274 KIF27Q86VH2 1401 aa27.88■■■□□ 2.05
PFKL-209ENST00000495274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.87■■■□□ 2.05
PFKL-209ENST00000495274 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.83■■■□□ 2.05
PFKL-209ENST00000495274 OSCARQ8IYS5 282 aa27.81■■■□□ 2.04
PFKL-209ENST00000495274 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.81■■■□□ 2.04
PFKL-209ENST00000495274 SYNJ2O15056 1496 aa27.8■■■□□ 2.04
PFKL-209ENST00000495274 IGF1RP08069 1367 aa27.78■■■□□ 2.04
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PFKL-209ENST00000495274 ADAMTS12P58397 1594 aa27.73■■■□□ 2.03
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PFKL-209ENST00000495274 EEA1Q15075 1411 aa27.53■■■□□ 2
PFKL-209ENST00000495274 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.52■■■□□ 2
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PFKL-209ENST00000495274 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.46■■□□□ 1.99
PFKL-209ENST00000495274 PRXQ9BXM0 1461 aa27.44■■□□□ 1.98
PFKL-209ENST00000495274 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.44■■□□□ 1.98
PFKL-209ENST00000495274 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.34■■□□□ 1.97
PFKL-209ENST00000495274 ARHGEF11O15085 1522 aa27.32■■□□□ 1.96
PFKL-209ENST00000495274 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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