Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H3

ATP23, Mitochondrial inner membrane protease ATP23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP23Q9Y6H3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP23Q9Y6H3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP23Q9Y6H3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP23Q9Y6H3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms