Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB2Q9Y5E7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB2Q9Y5E7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PCDHB2Q9Y5E7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms