Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y399

MRPS2, 28S ribosomal protein S2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS2Q9Y399 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS2Q9Y399 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPS2Q9Y399 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS2Q9Y399 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS2Q9Y399 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms