Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1Q9Y2A7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCKAP1Q9Y2A7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1Q9Y2A7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1Q9Y2A7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms