Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
MED23Q9ULK4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MED23Q9ULK4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
MED23Q9ULK4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms