Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN2Q9UL51 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCN2Q9UL51 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HCN2Q9UL51 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN2Q9UL51 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms