Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL3Q9UH77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL3Q9UH77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL3Q9UH77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms