Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHA6Q9UF33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHA6Q9UF33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA6Q9UF33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms