Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NKIRAS1Q9NYS0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS1Q9NYS0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms