Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRHQ9HD43 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRHQ9HD43 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRHQ9HD43 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRHQ9HD43 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRHQ9HD43 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRHQ9HD43 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRHQ9HD43 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRHQ9HD43 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRHQ9HD43 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms