Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF649Q9BS31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF649Q9BS31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF649Q9BS31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms