Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX50Q9BQ39 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX50Q9BQ39 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX50Q9BQ39 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX50Q9BQ39 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms