Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRTNQ99748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRTNQ99748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NRTNQ99748 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRTNQ99748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms