Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRTNQ99748 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NRTNQ99748 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRTNQ99748 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NRTNQ99748 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRTNQ99748 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRTNQ99748 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRTNQ99748 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRTNQ99748 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRTNQ99748 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRTNQ99748 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRTNQ99748 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NRTNQ99748 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NRTNQ99748 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRTNQ99748 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NRTNQ99748 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NRTNQ99748 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRTNQ99748 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRTNQ99748 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRTNQ99748 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRTNQ99748 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRTNQ99748 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRTNQ99748 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRTNQ99748 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRTNQ99748 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRTNQ99748 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRTNQ99748 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRTNQ99748 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRTNQ99748 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRTNQ99748 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRTNQ99748 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NRTNQ99748 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NRTNQ99748 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRTNQ99748 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRTNQ99748 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRTNQ99748 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRTNQ99748 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRTNQ99748 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRTNQ99748 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRTNQ99748 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRTNQ99748 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRTNQ99748 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRTNQ99748 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRTNQ99748 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRTNQ99748 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRTNQ99748 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRTNQ99748 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRTNQ99748 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NRTNQ99748 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRTNQ99748 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRTNQ99748 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRTNQ99748 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRTNQ99748 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRTNQ99748 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRTNQ99748 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRTNQ99748 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRTNQ99748 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRTNQ99748 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRTNQ99748 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRTNQ99748 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRTNQ99748 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NRTNQ99748 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRTNQ99748 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRTNQ99748 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NRTNQ99748 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRTNQ99748 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRTNQ99748 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRTNQ99748 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRTNQ99748 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRTNQ99748 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRTNQ99748 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRTNQ99748 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRTNQ99748 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRTNQ99748 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRTNQ99748 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NRTNQ99748 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRTNQ99748 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRTNQ99748 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRTNQ99748 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRTNQ99748 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRTNQ99748 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRTNQ99748 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRTNQ99748 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRTNQ99748 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRTNQ99748 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRTNQ99748 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRTNQ99748 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRTNQ99748 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRTNQ99748 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRTNQ99748 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRTNQ99748 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRTNQ99748 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRTNQ99748 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRTNQ99748 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms