Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SENP8Q96LD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SENP8Q96LD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP8Q96LD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP8Q96LD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP8Q96LD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms