Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC136Q96JN2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC136Q96JN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC136Q96JN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC136Q96JN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC136Q96JN2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC136Q96JN2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms