Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMA16Q96EY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMA16Q96EY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMA16Q96EY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMA16Q96EY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms