Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSI2Q96DH6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI2Q96DH6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI2Q96DH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms