Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L2Q8NAA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2Q8NAA4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L2Q8NAA4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms