Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD42Q8N9B4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD42Q8N9B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD42Q8N9B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD42Q8N9B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms