Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T0

TOP6BL, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP6BLQ8N6T0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP6BLQ8N6T0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP6BLQ8N6T0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP6BLQ8N6T0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP6BLQ8N6T0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP6BLQ8N6T0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP6BLQ8N6T0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP6BLQ8N6T0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP6BLQ8N6T0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOP6BLQ8N6T0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP6BLQ8N6T0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms