Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP8Q86W28 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP8Q86W28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP8Q86W28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms