Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2T5

TRMT1L, TRMT1-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1LQ7Z2T5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT1LQ7Z2T5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRMT1LQ7Z2T5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1LQ7Z2T5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1LQ7Z2T5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRMT1LQ7Z2T5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms