Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN5Q6U736 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN5Q6U736 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN5Q6U736 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms