Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC62Q6P9F0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC62Q6P9F0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC62Q6P9F0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC62Q6P9F0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC62Q6P9F0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms