Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SDE2Q6IQ49 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SDE2Q6IQ49 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SDE2Q6IQ49 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms