Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GARNL3Q5VVW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GARNL3Q5VVW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GARNL3Q5VVW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms