Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITRM1Q5JRX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITRM1Q5JRX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITRM1Q5JRX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITRM1Q5JRX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITRM1Q5JRX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITRM1Q5JRX3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITRM1Q5JRX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITRM1Q5JRX3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITRM1Q5JRX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms