Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A13Q5J8X5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A13Q5J8X5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A13Q5J8X5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms