Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC37Q16543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC37Q16543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC37Q16543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDC37Q16543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC37Q16543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
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