Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC2Q13753 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC2Q13753 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMC2Q13753 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC2Q13753 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMC2Q13753 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC2Q13753 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms