Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

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Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
LAMC2Q13753 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LAMC2Q13753 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LAMC2Q13753 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMC2Q13753 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LAMC2Q13753 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC2Q13753 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC2Q13753 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
LAMC2Q13753 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC2Q13753 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LAMC2Q13753 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LAMC2Q13753 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LAMC2Q13753 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC2Q13753 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC2Q13753 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LAMC2Q13753 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMC2Q13753 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LAMC2Q13753 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LAMC2Q13753 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LAMC2Q13753 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LAMC2Q13753 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC2Q13753 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LAMC2Q13753 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC2Q13753 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LAMC2Q13753 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LAMC2Q13753 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LAMC2Q13753 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC2Q13753 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LAMC2Q13753 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LAMC2Q13753 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LAMC2Q13753 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LAMC2Q13753 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMC2Q13753 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LAMC2Q13753 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LAMC2Q13753 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LAMC2Q13753 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMC2Q13753 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMC2Q13753 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LAMC2Q13753 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LAMC2Q13753 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LAMC2Q13753 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAMC2Q13753 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LAMC2Q13753 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LAMC2Q13753 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMC2Q13753 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LAMC2Q13753 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LAMC2Q13753 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC2Q13753 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC2Q13753 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC2Q13753 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC2Q13753 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC2Q13753 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC2Q13753 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC2Q13753 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC2Q13753 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC2Q13753 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAMC2Q13753 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMC2Q13753 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC2Q13753 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC2Q13753 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC2Q13753 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC2Q13753 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC2Q13753 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC2Q13753 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC2Q13753 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC2Q13753 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC2Q13753 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC2Q13753 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC2Q13753 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC2Q13753 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LAMC2Q13753 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC2Q13753 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC2Q13753 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC2Q13753 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMC2Q13753 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMC2Q13753 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMC2Q13753 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC2Q13753 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC2Q13753 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LAMC2Q13753 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMC2Q13753 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC2Q13753 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC2Q13753 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMC2Q13753 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMC2Q13753 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC2Q13753 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
LAMC2Q13753 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC2Q13753 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC2Q13753 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC2Q13753 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC2Q13753 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC2Q13753 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LAMC2Q13753 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMC2Q13753 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC2Q13753 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMC2Q13753 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC2Q13753 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMC2Q13753 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMC2Q13753 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMC2Q13753 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
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