Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHRNDQ07001 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CHRNDQ07001 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CHRNDQ07001 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHRNDQ07001 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNDQ07001 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms