Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG7P83436 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG7P83436 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG7P83436 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG7P83436 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG7P83436 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG7P83436 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COG7P83436 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG7P83436 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG7P83436 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG7P83436 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG7P83436 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG7P83436 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG7P83436 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG7P83436 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG7P83436 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COG7P83436 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG7P83436 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG7P83436 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG7P83436 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG7P83436 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG7P83436 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG7P83436 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COG7P83436 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG7P83436 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG7P83436 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG7P83436 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG7P83436 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG7P83436 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG7P83436 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG7P83436 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG7P83436 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG7P83436 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG7P83436 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG7P83436 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG7P83436 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG7P83436 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG7P83436 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG7P83436 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG7P83436 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG7P83436 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG7P83436 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG7P83436 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG7P83436 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG7P83436 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG7P83436 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG7P83436 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG7P83436 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COG7P83436 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COG7P83436 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG7P83436 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG7P83436 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG7P83436 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG7P83436 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG7P83436 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG7P83436 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG7P83436 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG7P83436 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG7P83436 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG7P83436 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG7P83436 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG7P83436 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG7P83436 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG7P83436 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG7P83436 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG7P83436 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG7P83436 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG7P83436 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG7P83436 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG7P83436 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG7P83436 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG7P83436 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG7P83436 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG7P83436 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG7P83436 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG7P83436 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.1 ms