Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1CAP62136 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1CAP62136 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1CAP62136 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1CAP62136 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms