Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP1P59025 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP1P59025 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP1P59025 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP1P59025 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP1P59025 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP1P59025 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP1P59025 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP1P59025 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTP1P59025 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTP1P59025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTP1P59025 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTP1P59025 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTP1P59025 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTP1P59025 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTP1P59025 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP1P59025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP1P59025 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP1P59025 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP1P59025 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP1P59025 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP1P59025 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTP1P59025 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP1P59025 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP1P59025 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP1P59025 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTP1P59025 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RTP1P59025 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTP1P59025 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTP1P59025 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTP1P59025 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RTP1P59025 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP1P59025 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP1P59025 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP1P59025 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP1P59025 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP1P59025 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP1P59025 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTP1P59025 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTP1P59025 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTP1P59025 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP1P59025 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP1P59025 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP1P59025 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP1P59025 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTP1P59025 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RTP1P59025 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTP1P59025 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTP1P59025 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RTP1P59025 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RTP1P59025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP1P59025 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP1P59025 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP1P59025 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP1P59025 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP1P59025 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTP1P59025 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RTP1P59025 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTP1P59025 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTP1P59025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTP1P59025 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTP1P59025 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTP1P59025 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTP1P59025 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP1P59025 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP1P59025 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP1P59025 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP1P59025 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP1P59025 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP1P59025 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP1P59025 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP1P59025 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP1P59025 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP1P59025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTP1P59025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTP1P59025 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTP1P59025 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTP1P59025 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTP1P59025 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RTP1P59025 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP1P59025 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP1P59025 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP1P59025 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP1P59025 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP1P59025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP1P59025 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP1P59025 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP1P59025 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP1P59025 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP1P59025 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP1P59025 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP1P59025 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP1P59025 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP1P59025 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP1P59025 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP1P59025 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP1P59025 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP1P59025 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP1P59025 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP1P59025 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms