Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX9P55771 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX9P55771 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX9P55771 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX9P55771 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX9P55771 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX9P55771 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX9P55771 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX9P55771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX9P55771 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX9P55771 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX9P55771 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX9P55771 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX9P55771 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX9P55771 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX9P55771 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX9P55771 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX9P55771 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX9P55771 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX9P55771 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX9P55771 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX9P55771 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX9P55771 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX9P55771 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX9P55771 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX9P55771 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX9P55771 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX9P55771 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX9P55771 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX9P55771 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX9P55771 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX9P55771 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX9P55771 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX9P55771 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX9P55771 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX9P55771 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX9P55771 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX9P55771 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX9P55771 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX9P55771 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX9P55771 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX9P55771 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX9P55771 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX9P55771 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX9P55771 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX9P55771 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX9P55771 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX9P55771 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX9P55771 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX9P55771 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX9P55771 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX9P55771 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX9P55771 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX9P55771 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX9P55771 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX9P55771 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX9P55771 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX9P55771 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX9P55771 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX9P55771 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX9P55771 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAX9P55771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX9P55771 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX9P55771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX9P55771 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX9P55771 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX9P55771 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX9P55771 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX9P55771 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX9P55771 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX9P55771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX9P55771 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX9P55771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX9P55771 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX9P55771 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX9P55771 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX9P55771 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX9P55771 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX9P55771 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX9P55771 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX9P55771 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX9P55771 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX9P55771 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX9P55771 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX9P55771 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX9P55771 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX9P55771 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX9P55771 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms