Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSC2P49815 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TSC2P49815 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC2P49815 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC2P49815 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC2P49815 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC2P49815 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC2P49815 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC2P49815 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC2P49815 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC2P49815 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC2P49815 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC2P49815 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC2P49815 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TSC2P49815 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSC2P49815 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSC2P49815 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSC2P49815 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC2P49815 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC2P49815 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC2P49815 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC2P49815 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC2P49815 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC2P49815 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC2P49815 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC2P49815 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC2P49815 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC2P49815 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC2P49815 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC2P49815 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC2P49815 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSC2P49815 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSC2P49815 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC2P49815 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC2P49815 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSC2P49815 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC2P49815 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSC2P49815 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC2P49815 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC2P49815 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC2P49815 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC2P49815 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC2P49815 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC2P49815 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC2P49815 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC2P49815 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC2P49815 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC2P49815 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC2P49815 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC2P49815 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC2P49815 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC2P49815 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC2P49815 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC2P49815 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC2P49815 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSC2P49815 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSC2P49815 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSC2P49815 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSC2P49815 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSC2P49815 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSC2P49815 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC2P49815 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC2P49815 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC2P49815 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC2P49815 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC2P49815 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC2P49815 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC2P49815 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC2P49815 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms