Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2IP36954 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2IP36954 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms