Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRF1P14222 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRF1P14222 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRF1P14222 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRF1P14222 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRF1P14222 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRF1P14222 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRF1P14222 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRF1P14222 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRF1P14222 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRF1P14222 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRF1P14222 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRF1P14222 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRF1P14222 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRF1P14222 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRF1P14222 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRF1P14222 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRF1P14222 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRF1P14222 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRF1P14222 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRF1P14222 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRF1P14222 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRF1P14222 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRF1P14222 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRF1P14222 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRF1P14222 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRF1P14222 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRF1P14222 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRF1P14222 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRF1P14222 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRF1P14222 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRF1P14222 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRF1P14222 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRF1P14222 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRF1P14222 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRF1P14222 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRF1P14222 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRF1P14222 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRF1P14222 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRF1P14222 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRF1P14222 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRF1P14222 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRF1P14222 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRF1P14222 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRF1P14222 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRF1P14222 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRF1P14222 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRF1P14222 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRF1P14222 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRF1P14222 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRF1P14222 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRF1P14222 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRF1P14222 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRF1P14222 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRF1P14222 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRF1P14222 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRF1P14222 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRF1P14222 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRF1P14222 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRF1P14222 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRF1P14222 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRF1P14222 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRF1P14222 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRF1P14222 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRF1P14222 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRF1P14222 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRF1P14222 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRF1P14222 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRF1P14222 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRF1P14222 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRF1P14222 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRF1P14222 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRF1P14222 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRF1P14222 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRF1P14222 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRF1P14222 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRF1P14222 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRF1P14222 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRF1P14222 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRF1P14222 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRF1P14222 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms