Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GNAT1P11488 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNAT1P11488 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNAT1P11488 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNAT1P11488 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNAT1P11488 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.6 ms