Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L7P0C7H9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L7P0C7H9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L7P0C7H9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms