Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC3A2P08195 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC3A2P08195 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC3A2P08195 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC3A2P08195 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC3A2P08195 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms