Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB3P05106 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB3P05106 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB3P05106 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3P05106 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms