Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRNPP04156 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRNPP04156 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRNPP04156 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRNPP04156 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRNPP04156 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRNPP04156 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRNPP04156 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRNPP04156 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRNPP04156 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRNPP04156 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRNPP04156 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRNPP04156 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRNPP04156 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRNPP04156 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRNPP04156 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRNPP04156 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRNPP04156 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRNPP04156 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRNPP04156 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRNPP04156 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRNPP04156 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRNPP04156 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRNPP04156 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRNPP04156 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRNPP04156 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRNPP04156 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRNPP04156 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRNPP04156 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRNPP04156 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRNPP04156 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRNPP04156 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRNPP04156 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRNPP04156 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRNPP04156 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRNPP04156 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRNPP04156 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRNPP04156 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRNPP04156 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRNPP04156 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRNPP04156 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRNPP04156 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRNPP04156 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRNPP04156 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRNPP04156 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRNPP04156 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRNPP04156 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRNPP04156 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRNPP04156 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRNPP04156 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRNPP04156 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRNPP04156 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRNPP04156 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRNPP04156 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRNPP04156 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRNPP04156 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRNPP04156 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRNPP04156 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRNPP04156 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRNPP04156 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRNPP04156 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRNPP04156 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRNPP04156 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRNPP04156 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRNPP04156 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRNPP04156 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRNPP04156 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRNPP04156 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRNPP04156 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRNPP04156 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRNPP04156 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRNPP04156 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRNPP04156 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRNPP04156 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRNPP04156 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRNPP04156 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRNPP04156 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRNPP04156 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRNPP04156 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRNPP04156 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms