Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD4O95243 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD4O95243 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD4O95243 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD4O95243 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD4O95243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD4O95243 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD4O95243 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD4O95243 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD4O95243 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
MBD4O95243 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD4O95243 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD4O95243 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD4O95243 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MBD4O95243 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MBD4O95243 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MBD4O95243 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MBD4O95243 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MBD4O95243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MBD4O95243 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MBD4O95243 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MBD4O95243 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MBD4O95243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MBD4O95243 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MBD4O95243 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MBD4O95243 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MBD4O95243 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MBD4O95243 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MBD4O95243 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MBD4O95243 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MBD4O95243 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MBD4O95243 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MBD4O95243 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MBD4O95243 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MBD4O95243 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MBD4O95243 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MBD4O95243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD4O95243 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD4O95243 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD4O95243 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD4O95243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD4O95243 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD4O95243 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD4O95243 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD4O95243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD4O95243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD4O95243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD4O95243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD4O95243 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD4O95243 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD4O95243 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD4O95243 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD4O95243 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD4O95243 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD4O95243 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD4O95243 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD4O95243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD4O95243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD4O95243 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD4O95243 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD4O95243 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD4O95243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD4O95243 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD4O95243 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD4O95243 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MBD4O95243 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MBD4O95243 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MBD4O95243 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MBD4O95243 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MBD4O95243 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MBD4O95243 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MBD4O95243 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MBD4O95243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MBD4O95243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MBD4O95243 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MBD4O95243 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MBD4O95243 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MBD4O95243 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MBD4O95243 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MBD4O95243 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MBD4O95243 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MBD4O95243 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MBD4O95243 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MBD4O95243 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms